Általában azért nem szokták ajánlani, mert a feltételes kötőjelek speciális karakterek, sokan nem szeretik teleszórni vele a könyvet. Ráadásul a méretet is növeli. Persze ez egyéni döntés dolga, kinek mi a fontos.
A Calibre-ben van a Hyphenate This plugin, azzal lehet az elválasztásokat kezelni. Sheraton fórumtárs írt róla részletesen itt.
Leginkább azért nem szokták ajánlani, mert nem mindegyik parser jeleníti meg (illetve tünteti el) helyesen. És ha olyan programmal//készülékkel nézed a könyvet, ahol a feltételes elválasztójelek mondjuk kis négyzetekként jelennek meg, akkor a végeredmény rosszabb, mintha nem volna elválasztás.
Ha csak magadnak csinálsz valamit, akkor nincs gond, ha működik boldogság van. De ha másnak is szánod a kész könyvet, akkor vagy érdemes letenni róla, vagy - mint pl. Mojo kolléga is csinálja - két (több) verzióban elkészíteni, egy leválasztás nélküli és egy elválasztásos változatban. Esetleg mégegyet beépített fontokkal.